Hola,
En la pestaña de respuestas procesadas puedes ver las fórmulas con las que se calcula cada promedio. Pincha en una celda calculada y verás la operación realizada.
Las puntuaciones que reciben los alumnos tienen que coincidir con las que figuran en esa hoja de cálculo. Revisa qué puede pasar en los alumnos que no reciben nota. Tal vez no estén bien asignados los porcentajes o tal vez algún alumno no haya realizado su autoevaluación correctamente... sin ver la hoja es difícil saber la causa.
Espero que te sirva